findMaxima (MaximumFinder)で解析範囲を指定する-3

繰り返しになるが、MaximumFinderクラスは、コンストラクタはMaximumFinder()なので、

MaximumFinder mf = new MaximumFinder()

となる。メソッドである、getMaximaもfindMaximaも引数としては

java.awt.Polygon getMaxima(ImageProcessor ip, double tolerance, boolean excludeOnEdges)

ByteProcessor findMaxima(ImageProcessor ip, double tolerance, int outputType, boolean excludeOnEdges)

であり、impはない。しかし、findMaximaの中ではimpを参照していることから、mfにimpを入れないといけない。 そこで、改めてメソッドを眺めてみると、

int setup(java.lang.String arg, ImagePlus imp)

あった！ありました！
たまに見るsetupメソッドだが、MaximumFinderで唯一impをパラメータとしている。ソースを見てみると、

public int setup(String arg, ImagePlus imp) {
        this.imp = imp;
        return flags;
    }

だけ。impをメンバ変数のimpに代入するだけのメソッドである。これを使えばよい。 まとめると、non-rectangularなRoiを解析範囲として指定するためには、

imp.setRoi(ovalRaoi);
MaximumFinder mf = new MaximumFinder()
mf.setup("", imp);
poly = mf.getMaxima(ip, tolerance, false);

とすればよい。imp.setRoi(ovalRoi)の時点で、ipにもovalRoiがセットされている。 以上がMaximumFinderでnon-rectangularな解析範囲をする方法だ（と思う）。 ここまでたどり着くの相当疲れた。。